علت آفت دهان نامشخص است اما بیشتر در افراد یک خانواده دیده میشود بدین معنا که بروز آفتها مکرر با تمایلات ژنتیکی مرتبط است. آفت دهان مسری و واگیر نیست.
علاوه بر این آفت دهان میتواند در شرایط زیر ایجاد گردد:
زمانیکه فرد خسته است و یا دچار استرس است.
برخی زنان در زمانیکه در سیکل قاعدگی خود قرار دارند.
در هنگام آسیب رساندن به دهان، مانند گاز گرفتن لب.
ایجاد فشار یا تحریک توسط دندانها.
وجود آلرژیهای غذایی. دریافت برخی غذاها که فرد نسبت به آنها آلرژی دارد میتواند منجر به ایجاد آفت شود. در یک مطالعه کوچک صورت گرفته در سال 1991، تست آلرژی غذایی در 20 نفر از بیماران مثبت بود. پس از حذف آن دسته از مواد غذایی که افراد شرکت کننده نسبت به آنها آلرژی داشتند، 18 نفر بهبود معناداری در آفتهایشان ایجاد شد.
دریافت آب میوهها و یا نوشیدنیهایی که محتوای بالایی از اسید دارند مانند آب پرتقال.
ضعف سیستم ایمنی.
در زمان عدم دریافت ویتامینها و مواد معدنی کافی از رژیم غذایی؛ درواقع کمبود مواد مغذی به ویژه آهن، اسیدفولیک، و ویتامین B12 فرد را مستعد ابتلا به آفتهای دهانی میکند؛ 20درصد از افرادی که به طور مکرر دچار آفتهای دهانی میشوند دچار کمبود ریز مغذیهای ذکر شده هستند:
آهن در جگر، گوشت قرمز، ماکیان، ماهی تن، میگو، جودوسر، لوبیا، عدس، پنیر توفو، و اسفناج یافت میشود.
اسید فولیک در حبوبات، مغزها، مارچوبه، آواکادو، بروکلی، مرکبات، سبزیجات برگدار سبز، جگر، ماکیان، و غلات کامل گندم یافت میشود.
ویتامین B12 نیز در گوشت قرمز، جگر، ماهی، تخم مرغ، مخمر خوراکی، و برخی غلات غنی شده صبحانه یافت میشود.